Ержан Токтарханов родился в 1975 году в Восточно-Казахстанкой области. По образованию – экономист, юрист. Окончил Восточно-Казахстанкий университет, Государственный Восточно-Казахстанкий университет им. С. Аманжолова.
Стаж работы на госслужбе составляет 24 года. С 1997 года работал от налогового инспектора до председателя Налогового комитета по г. Усть-Каменогорску.
В разные годы занимал должность руководителя управлений в Департаменте государственных доходов по Карагандинской области, а также руководил Управлением государственных доходов по Сарыаркинскому району г. Астана.
С 2019 года до настоящего времени занимал должность директора Департамента контроля и Департамента информационных технологий Комитета государственных доходов МФ РК.